L´actuel Couvent de Sainte Isabelle était originairement un béguinage féminin, fondé en 1472 par Juana de Hermosilla. En 1488 il devient sous l´autorisation d’Inocencio VIII une communauté secondaire des Franciscaines et on le ferme au début du XVII siècle. Actuellement c'est la communauté des Mères Clarisses qui l’occupe.

Entre les édifices qui composent le couvent, il faut signaler l´église et le cloître. L´église commença à se construire en 1506, en forme rectangulaire structurée en trois parties, sous l'influence gothique. En 1720 les travaux de Manuel Godoy introduisent une ornementation de la Renaissance. Le temple abrite les sculptures de Francisco Velázquez, Gregorio Fernández ou Juan de Juni. Le cloître annexe de deux hauteurs avec des traceries gothiques sur les rambardes et un étage trapézoïdal. Ce cloître a été restauré et ouvert au public en 1989. On peut visiter l'église, le Musée du monastère, le cloître, différentes salles, la cuisine, la Bibliothèque et certaines chapelles.