Le temple actuel, faisait partie des installations du couvent fondé en 1407, et suite à une cession de certains terrains de la part du connétable de Castille : Ruy López Dávalos. L´église originaire fut remplacée en 1550, date à laquelle on commença la construction du chevet, de la croisée du transept et des deux premières chapelles.

Les travaux continuèrent en 1619 sous les ordres de Diego de Praves qui termina la façade principale avec les armoiries des comtes de Villamediana, et terminèrent en 1664 : se fut le début de deux siècles de gloire et de splendeur pour le couvent.

Au XIX siècle, à l´époque du Désamortissement de Mendizábal, il fut utilisé comme caserne de l'armée française durant la Guerre d´Indépendance. Vu l'importance archéologique de la zone, il y a eu d'importantes fouilles, il fut transformé en Archives Municipal et on récupéra l'arcature du couvent que l'on avait démontée en 1920.